En aquel momento, el juez no encontró elementos para continuar con el proceso judicial en su contra y les concedió plena libertad.
Así lo confirmó a la red informativa de ARPAS, Arnau Baulenas, abogado de la UCA y quien es acusador particular en el caso:

A pesar que organizaciones sociales han pedido que el expresidente de la República Alfredo Cristiani y el alto mando de la Fuerza Armada de 1989 sean procesados como presuntos autores intelectuales del crimen, Arnaul Baulenas sostuvo que esto aún no se puede determinar.

A partir de la decisión del juzgado la Fiscalía debe presentar un nuevo requerimiento, aunque no hay un plazo definido para esto.

Finalmente, Arnaul Baulenas habló sobre la importancia de esta acción del Juzgado Tercero de Paz:

El caso por la masacre de los jesuitas nunca fue investigado, pues en el año 2000 el sistema de justicia declaró que la acusación no procedía pues permanecía vigente la ley de amnistía y el delito había prescrito.